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9001-99-4 / 核糖核酸酶A的提取方法

背景及概述[1]

核糖核酸酶A是一類(lèi)水解RNA的酶,廣泛存在于所有動(dòng)植物和微生物中,按其作用位點(diǎn)和磷酸酯鍵斷裂的方式可分為生成3′-磷酸基團(tuán)的內(nèi)切核糖核酸酶(膜核糖核酸酶、核糖核酸酶T1和生成5′-磷酸基團(tuán)的內(nèi)切核酸酶(RNase H)、外切核糖核酸酶(大腸桿菌RNaseⅡ、大腸桿菌的寡核苷酸RNase、RNA的腫瘤病毒的RNase H)。核糖核酸酶,核糖核酸酶T1是實(shí)驗(yàn)室中除去樣品中的RNA或RNA順序測(cè)定中常用的酶。胰核糖核酸酶(RNase A)是從牛胰中提取的RNase,是高度專(zhuān)一的內(nèi)切核酸酶,專(zhuān)一水解RNA鏈中的嘧啶核苷酸鍵,生成3′-嘧啶核苷酸或3′末端為嘧啶核苷酸的寡核苷酸,核糖核酸酶T1是從米曲霉菌中制備的一種高度專(zhuān)一性的內(nèi)切核酸酶,專(zhuān)一水解RNA產(chǎn)生3′鳥(niǎo)苷酸和3′端為鳥(niǎo)苷酸的寡核酸。核糖核酸酶H(RNase H)常用于反轉(zhuǎn)錄合成中,只作用于DNA-RNA雙鏈中的RNA。

提取方法[2]

一種核糖核酸酶A的提取方法,分離提純具有酶活性的、高純度的S核糖核酸酶,可用于分離提純其它薔薇科果樹(shù)(如蘋(píng)果、杏、梅、櫻桃等)雌 蕊S基因的S核糖核酸酶和其它植物組織特異性蛋白質(zhì)。本發(fā)明所提供的一種核糖核酸酶提取方法,包含下列步驟:

1)植物樣品的采集:采集開(kāi)花前的大花蕾,從花蕾分解出花柱,經(jīng)稱(chēng)重后裝入塑 料瓶?jī)?nèi),保存于液氮中待用;

2)抽提液的制備(配方):以MES/NaOH緩沖液(pH=6.5)為制備抽提液的溶液, 按溶液體積比添加3%的polyclar-AT、1.5%抗壞血酸鈉和5mmol·L-1的EDTA·Na2, 得到核糖核酸酶抽提液A;

3)抽提過(guò)程:

在1~4℃低溫條件下,取花柱樣品,加入上述核糖核酸酶抽提液A進(jìn)行提取后,離心,上清液為花柱可溶性蛋白質(zhì)溶液,經(jīng)過(guò)孔經(jīng)0.45μm的過(guò)濾網(wǎng)過(guò)濾后,以流速 0.5~1ml/min的速率通過(guò)CM瓊脂糖凝膠(CM sepharose)陽(yáng)離子交換層析柱之后,用 100~200ml的20mmol·L-1 MES/NaOH緩沖液清洗上述CM層析柱,而后用100~200ml 的350mmol·L-1NaCl溶液將核糖核酸酶從CM層析柱中洗脫下來(lái),獲得核糖核酸酶 溶液B;

按體積比添加4倍液的20mmol·L-1MES/NaOH緩沖液稀釋?zhuān)瑯咏?jīng)孔徑0.45μm 的過(guò)濾網(wǎng)過(guò)濾后,將其以流速0.5~1ml/min的速率通過(guò)SP瓊脂糖凝膠(SP sepharose) 陽(yáng)離子交換層析柱;用100~200ml的180mmol·L-1NaCl溶液以相同的流速來(lái)清洗上述SP層析柱;再用100~200ml的250~320mmol·L-1的NaCl溶液將吸附于SP層析柱內(nèi)的核糖核酸酶全部溶出,回收得到核糖核酸酶溶液C;

核糖核酸酶溶液C用按溶液體積計(jì)算100%飽和的硫酸銨沉析后離心,獲得核糖 核酸酶。

相關(guān)研究[3-4]

王立霞等人為了了解核糖核酸酶ARnaseⅢrncS基因缺失對(duì)單核細(xì)胞增生李斯特菌(LM)環(huán)境應(yīng)激和生物被膜形成的影響,以LMSB5強(qiáng)毒株為對(duì)象,利用溫度敏感型穿梭質(zhì)粒pKSV7,通過(guò)基因重疊延伸PCR(SOE-PCR)和同源重組技術(shù)構(gòu)建LM-ΔrncS基因缺失突變株,檢測(cè)其在不同溫度、pH、高鹽、乙醇、H2O2脅迫環(huán)境下的適應(yīng)能力,通過(guò)結(jié)晶紫染色法檢測(cè)生物被膜的形成能力。

結(jié)果:與LM-SB5株相比,構(gòu)建的LM-ΔrncS在37℃、pH 4及pH 7的環(huán)境適應(yīng)能力無(wú)顯著變化(P>0.05),而在30℃、42℃、pH 9、5%NaCl、3.8%乙醇、0.1%H2O2的應(yīng)激環(huán)境下其適應(yīng)能力及生物被膜的形成能力顯著降低(P<0.05),提示RnaseⅢRncS參與了LM對(duì)低溫、高溫、堿、高鹽、乙醇及H2O2脅迫環(huán)境的適應(yīng)過(guò)程及生物被膜形成的調(diào)控。結(jié)論:構(gòu)建的LM-ΔrncS基因缺失突變株,在不同應(yīng)激環(huán)境下的適應(yīng)能力及生物被膜形成能力均顯著降低,為RnaseⅢRncS參與LM ncRNA調(diào)控環(huán)境應(yīng)激的分子機(jī)制研究奠定了基礎(chǔ)。

楊科成等人利用分子動(dòng)力學(xué)模擬研究了在不同尿素濃度下,核糖核酸酶Sa(RNase Sa)表面水和尿素分子的分布和動(dòng)力學(xué)行為。結(jié)果表明,尿素分子可與RNase Sa酶形成較強(qiáng)的相互作用,并取代其表面的水分子而富集在蛋白質(zhì)表面。尿素分子更傾向與RNase Sa酶的疏水殘基作用,與RNase Sa酶主鏈形成氫鍵的能力更強(qiáng)。尿素分子的平動(dòng)和轉(zhuǎn)動(dòng)遠(yuǎn)遠(yuǎn)慢于水分子的平動(dòng)和轉(zhuǎn)動(dòng)。RNase Sa酶表面水分子的平動(dòng)和轉(zhuǎn)動(dòng)隨著尿素濃度增加而逐漸變慢,但RNase Sa酶表面尿素分子的動(dòng)力學(xué)并不依賴(lài)于尿素濃度變化。本研究中明晰的RNase Sa酶表面水和尿素分子分布和動(dòng)力學(xué)有助于理解水和尿素分子對(duì)蛋白質(zhì)穩(wěn)定性的影響。

主要參考資料

[1] 衛(wèi)生學(xué)大辭典

[2] CN02137955.6 一種核糖核酸酶A的提取方法

[3] 王立霞,孟慶玲,喬軍,蔡擴(kuò)軍,王登峰,伍曄暉,王熙鳳,郭晶,才學(xué)鵬.核糖核酸酶ARnaseⅢ rncS基因缺失對(duì)單核細(xì)胞增生李斯特菌環(huán)境應(yīng)激的調(diào)控作用研究[J].中國(guó)病原生物學(xué)雜志,2018,13(10):1078-1083.

[4]楊科成,崔鳳超,李云琦.核糖核酸酶Sa表面水和尿素分子的分布和動(dòng)力學(xué)行為的分子動(dòng)力學(xué)模擬[J].應(yīng)用化學(xué),2018,35(10):1243-1248.

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